Krebscykeln kallas också trikarboxylsyracykeln och använder acetylkoezim A som utgångsmetabolit, som erhålls genom verkan av pyruvatdehydrogenas på pyruvat som produceras av glykolys.
ATP och reducerande effekt erhålls från krebscykeln; reducerande kraft skickas till andningskedjan där NADH och FADH2 oxideras till NAD + respektive FAD: reducerande kraft överförs, längs andningskedjan, till kopplingssystem från vilka ytterligare ATP produceras.
Krebscykeln är ett nervcentrum inte bara för glukosmetabolism utan också för metabolismen av fettsyror och aminosyror, faktiskt kommer pyruvat som omvandlas till acetylkoenzym A inte bara från nedbrytningen av glukos: det erhålls, för exempel, också från transaminering av alanin (en aminosyra).
Cirka 80% av acetylkoenzym A som deltar i krebscykeln kommer från metabolismen av fettsyror.
Acetylkoenzym A är en tioester, därför har den ett högt energiinnehåll som utnyttjas av citratsyntas att bilda en ny kol-kol-bindning; citratsyntas är det första enzymet i krebscykeln.
Metylkolet av acetylkoenzym A frisätter villigt (genom tautomerism) en proton (blir till en karbonjon) och angriper karbonylkolet av oxaloacetat: en tioester med hög energiinnehåll (citrilkoenzym A) bildas från vilket, genom hydrolys, citratet erhålls och koenzym A. reformeras. Citratsyntas moduleras negativt av produkten, det vill säga av citratet och av ATP: om citrat ackumuleras betyder det att detta steg är snabbare än de andra därför måste det bromsa (citrat är ett negativt modulator).
ATP påverkar också verkan av citratsyntas eftersom reducerande effekt erhålls från krebscykeln som sedan skickas till andningskedjan från vilken ATP produceras; om ATP ackumuleras betyder det att mer än vad som behövs produceras. Genom att sakta ner krebscykeln (cykeln saktar ner om ett av dess stadier saktas ner) sänks också produktionen av ATP: den negativa moduleringen av ATP är en återkopplingsmodulering (bildandet av en av slutprodukterna är moduleras genom att justera hastigheten för ett steg i processen).
I det andra stadiet av krebscykeln omvandlas citratet till isocitrat genom enzymets verkan akonitas; enzymets namn härrör från att citratet först dehydreras med bildandet av cis-akonitat och därefter kommer vattnet in igen genom att fästa sig vid ett kol som skiljer sig från det på vilket det tidigare var bundet. Isocitratet erhålls utan att substratet lämnar det katalytiska stället; akonitas är ett stereospecifikt enzym: det känner igen citratets tre karboxylcentra och detta gör att citrat förblir bundet till enzymet så att utgången och inträdet av "vattnet alltid passerar genom cis-akonitat-mellanprodukten.
I den tredje etappen av krebscykeln finns det första energihänsyn eftersom det är förlusten av ett kol som elimineras som koldioxid. Enzymet som katalyserar detta steg är isocitrat dehydrogenas; substratet genomgår först och främst en dehydrogenering: NAD + får reducerande effekt och oxalosuccinat bildas (det är ett oxalderivat av bärnstenssyra). Oxalosuccinatet genomgår sedan dekarboxylering till a-ketoglutarat.
Enzymet isocitrat dehydrogenas har två moduleringsställen: en positiv modulering på grund av ADP och en negativ modulering på grund av ATP. Mängden ATP som konsumeras dagligen är mycket hög: ATP ger den energi som frigörs genom dess hydrolys, "ADP och allt" ortofosfat.
Den totala koncentrationen av nukleosider (kvävebas plus socker) och nukleotider (nuklosid plus fosfat) i en organism är nästan konstant: att säga att c "är mycket ATP eller lite ADP (eller tvärtom, mycket ADP och lite ATP) är samma sak; ADP är en synonym för energibehov och är därför en positiv modulator, medan ATP är ett symptom på energitillgänglighet och därför är en negativ modulator.
FORTSÄTT: Andra delen "