Vanliga aminosyror och proteinsyntes
Aminosyrorna som förekommer oftast i proteinstrukturerna hos levande organismer kallas vanliga eller proteinogena aminosyror. Även om över 500 typer av aminosyror är kända i naturen, finns det bara tjugo som vi kallar vanliga. Tillsammans med dem finns det några sällsynta sådana, kallade enstaka, som i allmänhet härrör från metabolismen hos vanliga efter införlivandet i proteinkedjan. I kollagen finns till exempel lysin och prolin, två vanliga aminosyror, i hydroxylerad form (hydroxiprolin och hydroxylisin).
De flesta andra icke-vanliga aminosyror faller huvudsakligen inom konstitueringen av enzymer och hormoner av proteinkaraktär, eller snarare peptid (kom ihåg att ett protein måste bestå av mer än 100 aminosyror, för att bilda ett oligo respektive en polypeptid 2 till 9 och 10 till 100 är tillräckliga).
Bland de 20 vanliga aminosyrorna kommer man ihåg
Alanin, Arginin, Asparagin, Asparaginsyra, Cystein, Glycin, Glutaminsyra, Glutamin, Histidin, Isoleucin, Leucin, Lysin, Metionin, Fenylalanin, Proline, Serin, Treonin, Tryptofan, Tyrosin, Valin
Exempel på icke-vanliga aminosyror är:
karnitin (involverad i transport av långkedjiga fettsyror inuti mitokondrionen, där de används för att producera energi);
ornitin, citrullin och homocystein (delta i metabolismen av aminosyror - ureacykel);
hydroxiprolin och hydroxylisin (de är en del av sammansättningen av kollagen och några proteiner);
sarkosin (eller metylglycin).
Vissa aminosyror kan också ha kommersiell eller farmakologisk betydelse.
- Natriumglutamat används i livsmedelsindustrin som smakförstärkare (se buljongtärning).
- L-dihydroxifenylalanin (L-DOPA) är ett läkemedel som används för behandling av Parkinsons sjukdom.
- 5-hydroxytryptofan (5-HTP) har använts för behandling av neurologiska symptom i samband med fenylketonuri (en ärftlig metabolisk sjukdom som förhindrar användning av fenylalanin, en essentiell aminosyra, på grund av särskilda enzymatiska underskott; ackumulering av fenylalanin i vävnaderna är ansvarig för allvarlig hud- och neurologisk skada).
Växter och bakterier kan producera särskilda aminosyror, som finns i peptidantibiotika, såsom nisin och alameticin.
Essentiella aminosyror
Några av de 20 vanliga aminosyrorna kallas essentiella, eftersom de inte kan syntetiseras av kroppen från andra föreningar, utan måste tas med mat.
För människor är dessa fenylalanin, leucin, isoleucin, lysin, metionin, treonin, tryptofan, valin och hos barn histidin och arginin.
Vanliga aminosyror, kemiska egenskaper
Baserat på R -radikalens kemiska egenskaper (grupp av atomer som bildar en inte särskilt lång kedja) kan aminosyror delas in i olika kategorier.
Aminosyror med apolärt R (kan inte bilda vätebindningar):
med alifatisk kedja: alanin, leucin, isoleucin, valin, prolin
med aromatisk kedja: fenylalanin, tryptofan
med en kedja innehållande en svavelatom: metionin
Aminosyror med polärt R:
med OH -grupp: serin, treonin, tyrosin
med SH -grupp: cystein
med CO-NH2-grupp: asparagin, glutamin
med H: glycin (den enda icke-kirala aminosyran)
Aminosyror med basisk R:
lysin, arginin, histidin
Aminosyror med syra R:
glutaminsyra, asparaginsyra